微生物代謝國家重點實驗室（上海交通大學）是2011年4月經科技部批準立項建設的國家級科研機構，依托上海交通大學開展微生物代謝領域的基礎與應用研究。實驗室由中國科學院院士鄧子新任主任，聚焦合成代謝、分解代謝與代謝互作三大研究方向，在DNA硫化修飾、抗生素生物合成等領域取得多項國際影響力成果 [3]。
實驗室擁有分布于徐匯校區和閔行校區的科研設施 ，配備先進實驗設備，承擔微生物學、生物工程等學科的國家級科研任務。其團隊通過基礎研究與技術轉化的結合，持續推進微生物代謝機制解析與產業化應用，同時開展生態文明科普等社會服務工作。


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